Эколого-просветительская деятельность заповедника направлена на обеспечение поддержки идей заповедного дела и пропаганду бережного отношения к природе путем формирования позитивного экологического мышления и развития экологической культуры среди широких слоев населения.
Традиционным направлением эколого-просветительской работы с посетителями служат экспозиции в музее природы. Здание музея находится на центральной усадьбе заповедника, в поселке Якша.
Созданная в середине прошлого века как эксперимент по одомашниванию лося, в наши дни лосеферма играет большую роль в экопросветительской деятельности заповедника и является базой для сохранения племенного поголовья.